Python Recipe for Deduplicating 'rs' Values within 'sampleid' Range in Dataiku

Answered using ChatGPT 4o by ChatGPT4o

Question:

dataiku создать python рецепт для дедупликации значений rs внутри диапазона значений sampleid. Т.е. внутри диапазона sampleid нужно удалить строки повторяющиеся rs

Answer:

Для создания Python рецепта в Dataiku, который будет удалять строки с повторяющимися значениями rs внутри диапазона значени�� sampleid, можно использовать библиотеку pandas. Вот пример кода, который выполняет эту задачу:

  1. Откройте Dataiku и создайте новый Python рецепт.
  2. Вставьте следующий код в реда��тор рецепта:
import dataiku
import pandas as pd

# Загрузка входных данных
input_dataset = dataiku.Dataset("input_dataset_name")
df = input_dataset.get_dataframe()

# Удаление ��убликатов rs внутри каждого sampleid
df_deduplicated = df.drop_duplicates(subset=['sampleid', 'rs'])

# Создание вых��дного набора данных
output_dataset = dataiku.Dataset("output_dataset_name")
output_dataset.write_with_schema(df_deduplicated)

В этом коде:

  • input_dataset_name замените на имя вашего входного набора данных.
  • output_dataset_name замените на имя вашего выходного набора данных.

Этот код выполняет следующие шаги:

  1. Загружает входной набор данных в DataFrame.
  2. Удаля��т дубликаты значений rs внутри каждого sampleid с помощь�� метода drop_duplicates.
  3. Записывает результат в выходной набор данных.

После вставки и сохранения кода, запустите рецепт, чтобы применить дедупликацию к ваше��у набору данных.